home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Info-Mac 3 / Info_Mac_1994-01.iso / Applications / CC Converter / CC test doc < prev    next >
Text File  |  1993-10-28  |  18KB  |  301 lines
  1.  /H:Help       /P:Previous step  /A:Database menu             /S:Search menu
  2.  DOCUMENTS        1 TO        7                PAGE =     1 OF     13
  3.  CAUL/ISI09   DOCUMENT=       1 OF       7
  4.   PUBDATE  = 9309           INDATE   = 930922
  5.  RT        I
  6.  UI        LU957-0021
  7.  TI        KINETIC PCR ANALYSIS - REAL TIME MONITORING OF DNA AMPLIFICATION
  8.            REACTIONS
  9.  AU        HIGUCHI R (Reprint).  FOCKLER C.  DOLLINGER G.  WATSON R.
  10.  AD        ROCHE MOLEC SYST INC, 1145 ATLANTIC AVE, ALAMEDA, CA, 94501 USA
  11.            (Reprint).  CHIRON CORP, EMERYVILLE, CA, 94608 USA
  12.  SO        BIO-TECHNOLOGY, 1993 SEP, v11, n9 p.1026-1030
  13.  AB        We describe a simple, quantitative assay for any amplifiable DNA
  14.            sequence that uses a video camera to monitor multiple polymerase
  15.            chain reactions (PCRs) simultaneously over the course of
  16.            thermocycling. The video camera detects the accumulation of
  17.            double-stranded DNA (dsDNA) in each PCR using the increase in the
  18.            fluorescence of ethidium bromide (EtBr) that results from its binding
  19.            duplex DNA. The kinetics of fluorescence accumulation during
  20.            thermocycling are directly related to the starting number of DNA
  21.            copies. The fewer cycles necessary to produce a detectable
  22.            fluorescence, the greater the number of target sequences. Results
  23.  -------------------------   Press ENTER to see more   -------------------------
  24.  /H:Help       /P:Previous step  /A:Database menu           /S:Search menu
  25.  /U:Scroll up  /F:Print offline  /Q:Quit  /O:Other options  /N:STAIRS  Cmd: __
  26.  DOCUMENTS        1 TO        7                PAGE =     2 OF     13
  27.            obtained with this approach indicate that a kinetic approach to PCR
  28.            analysis can quantitate DNA sensitively, selectively and over a large
  29.            dynamic range. This approach also provides a means of determining the
  30.            effect of different reaction conditions on the efficacy of the
  31.            amplification and so can provide insight into fundamental PCR
  32.            processes.
  33.  KP        POLYMERASE CHAIN REACTION.  ENZYMATIC AMPLIFICATION.  SEQUENCES.
  34.            INVITRO
  35.  JS        BIOTECHNOLOGY & APPLIED MICROBIOLOGY
  36.  RE        18 REFS
  37.  LA        ENGLISH
  38.  DO        ARTICLE
  39.  IS        0733-222X
  40.  TC        For table of contents see UI LU957-0000
  41.  AA        Y
  42.  GA        LU957
  43.  CAUL/ISI09   DOCUMENT=       2 OF       7
  44.   PUBDATE  = 9309           INDATE   = 930922
  45.  RT        I
  46.  UI        LU957-0024
  47.  -------------------------   Press ENTER to see more   -------------------------
  48.  /H:Help       /P:Previous step  /A:Database menu           /S:Search menu
  49.  /U:Scroll up  /F:Print offline  /Q:Quit  /O:Other options  /N:STAIRS  Cmd: __
  50.  DOCUMENTS        1 TO        7                PAGE =     3 OF     13
  51.  TI        A REVERSE TRANSCRIPTASE POLYMERASE CHAIN REACTION ASSAY FOR THE
  52.            DETECTION AND QUANTITATION OF MURINE RETROVIRUSES
  53.  AU        IRVING J M.  CHANG L W S.  CASTILLO F J (Reprint).
  54.  AD        XOMA CORP, 2910 7TH ST, BERKELEY, CA, 94710 USA (Reprint).  XOMA
  55.            CORP, 2910 7TH ST, BERKELEY, CA, 94710 USA
  56.  SO        BIO-TECHNOLOGY, 1993 SEP, v11, n9 p.1042-1046
  57.  AB        Specific hybridization primers for the PCR assay were developed to
  58.            detect the presence of the ecotropic, xenotropic, and mink cell
  59.            focus-forming classes of murine leukemia viruses (MuLVs) in samples
  60.            derived from cultured cells and cell-free supernatants. The primers,
  61.            which were tested against reference viruses from all three classes
  62.            and two subclasses and accurately identified each class present, were
  63.            used to characterize the endogenous expression of MuLV-related
  64.            sequences in a number of murine and mink cell lines. Two
  65.            murine/murine hybridomas were shown to contain expressed retroviral
  66.            sequences from all three classes. The murine cell lines SC-1, Balb/c
  67.            3T3, and NIH 3T3, were found to constitutively express sequences from
  68.            many of the MuLV classes. These MuLV-related sequences were not
  69.            expressed in the Mus dunni or mink lung cell lines. When these
  70.            primers were used in a quantitative PCR assay to determine the
  71.  -------------------------   Press ENTER to see more   -------------------------
  72.  /H:Help       /P:Previous step  /A:Database menu           /S:Search menu
  73.  /U:Scroll up  /F:Print offline  /Q:Quit  /O:Other options  /N:STAIRS  Cmd: __
  74.  DOCUMENTS        1 TO        7                PAGE =     4 OF     13
  75.            retroviral content of hybridoma supernatants, the values were less
  76.            variable than those obtained by transmission electron microscopy
  77.            (TEM). This assay can be adapted to detect and quantitate any viral
  78.            contaminant in cell culture supernatants, ascites fluids, process
  79.            validation samples, and final products.
  80.  KP        LEUKEMIA VIRUSES.  SEQUENCES.  PROBES.  MICE.  RNA
  81.  JS        BIOTECHNOLOGY & APPLIED MICROBIOLOGY
  82.  RE        34 REFS
  83.  LA        ENGLISH
  84.  DO        ARTICLE
  85.  IS        0733-222X
  86.  TC        For table of contents see UI LU957-0000
  87.  AA        Y
  88.  GA        LU957
  89.  CAUL/ISI08   DOCUMENT=       3 OF       7
  90.   PUBDATE  = 9300           INDATE   = 930814
  91.  RT        I
  92.  UI        LB968-0037
  93.  TI        APPLICATION OF THE POLYMERASE CHAIN REACTION TECHNIQUE TO THE
  94.            DETECTION OF PATHOGENS IN WATER
  95.  -------------------------   Press ENTER to see more   -------------------------
  96.  /H:Help       /P:Previous step  /A:Database menu           /S:Search menu
  97.  /U:Scroll up  /F:Print offline  /Q:Quit  /O:Other options  /N:STAIRS  Cmd: __
  98.  DOCUMENTS        1 TO        7                PAGE =     5 OF     13
  99.  AU        TORANZOS G A (Reprint).  ALVAREZ A J.  DVORSKY E A.
  100.  AD        UNIV PUERTO RICO, DEPT BIOL, RIO PIEDRAS, PR, 00931 USA (Reprint)
  101.  SO        WATER SCIENCE AND TECHNOLOGY, 1993 v27, n3-4 p.207-210
  102.  AB        Enteric pathogens may be present in fecally contaminated waters at
  103.            extremely low concentrations. In addition, these pathogens may be
  104.            injured when exposed to the environment and may not be able to grow
  105.            in laboratory culture media or such media may simply not exist for
  106.            their progagation in the laboratory. It is paramount thus to use
  107.            techniques which do not depend on culture techniques for the
  108.            detection of these pathogens and that allow for the detection of
  109.            single-cell concentrations. The polymerase chain reaction (PCR)
  110.            technique has been shown to be an excellent and sensitive means of
  111.            detecting pathogens in waters. Membrane filtration has been combined
  112.            with PCR and DNA hybridization techniques to be able to detect the
  113.            DNA equivalent of one single cell in large volumes of water. In
  114.            addition, this combination of methods allows for the amplification of
  115.            different target genes that may be present in the sample, since the
  116.            membrane can be subjected to repeated amplification reactions under
  117.            different conditions. A Most Probable Number PCR was developed which
  118.            allows for the quantification of gene copy number and thus permits
  119.  -------------------------   Press ENTER to see more   -------------------------
  120.  /H:Help       /P:Previous step  /A:Database menu           /S:Search menu
  121.  /U:Scroll up  /F:Print offline  /Q:Quit  /O:Other options  /N:STAIRS  Cmd: __
  122.  DOCUMENTS        1 TO        7                PAGE =     6 OF     13
  123.            extrapolation to estimate the number of bacterial cells in the
  124.            original sample.
  125.  AK        MPN PCR.  ENTERIC PATHOGENS.  WATER MICROBIOLOGY.  QUANTITATIVE PCR
  126.  KP        DNA
  127.  JS        WATER RESOURCES.  ENVIRONMENTAL SCIENCES.  ENGINEERING, CIVIL
  128.  RE        14 REFS
  129.  LA        ENGLISH
  130.  DO        ARTICLE
  131.  IS        0273-1223
  132.  TC        For table of contents see UI LB968-0000
  133.  AA        Y
  134.  GA        LB968
  135.  CAUL/ISI08   DOCUMENT=       4 OF       7
  136.   PUBDATE  = 9307           INDATE   = 930814
  137.  RT        I
  138.  UI        LM932-0002
  139.  TI        AN ELECTROCHEMILUMINESCENCE BASED DETECTION SYSTEM FOR QUANTITATIVE
  140.            PCR
  141.  AU        ANDERSON M S (Reprint).  DICESARE J L.  KATZ E D.
  142.  AD        PERKIN ELMER CORP, INSTRUMENT MARKETING, 761 MAIN AVE, NORWALK, CT,
  143.  -------------------------   Press ENTER to see more   -------------------------
  144.  /H:Help       /P:Previous step  /A:Database menu           /S:Search menu
  145.  /U:Scroll up  /F:Print offline  /Q:Quit  /O:Other options  /N:STAIRS  Cmd: __
  146.  DOCUMENTS        1 TO        7                PAGE =     7 OF     13
  147.            06859 USA (Reprint)
  148.  SO        AMERICAN BIOTECHNOLOGY LABORATORY, 1993 JUL, v11, n8 p.10-10
  149.  JS        BIOTECHNOLOGY & APPLIED MICROBIOLOGY
  150.  RE        NO REFS
  151.  LA        ENGLISH
  152.  DO        ARTICLE
  153.  IS        0749-3223
  154.  TC        For table of contents see UI LM932-0000
  155.  AA        N
  156.  GA        LM932
  157.  CAUL/ISI08   DOCUMENT=       5 OF       7
  158.   PUBDATE  = 9302           INDATE   = 930812
  159.  RT        I
  160.  UI        KP837-0008
  161.  TI        USING RANDOMLY AMPLIFIED POLYMORPHIC DNA FOR EVALUATING GENETIC
  162.            RELATIONSHIPS AMONG PAPAYA CULTIVARS
  163.  AU        STILES J I (Reprint).  LEMME C.  SONDUR S.  MORSHIDI M B.
  164.            MANSHARDT R.
  165.  AD        UNIV HAWAII, COLL TROP AGR & HUMAN RESOURCES, DEPT PLANT MOLEC
  166.            PHYSIOL, HONOLULU, HI, 96822 USA (Reprint).  UNIV HAWAII, COLL TROP
  167.  -------------------------   Press ENTER to see more   -------------------------
  168.  /H:Help       /P:Previous step  /A:Database menu           /S:Search menu
  169.  /U:Scroll up  /F:Print offline  /Q:Quit  /O:Other options  /N:STAIRS  Cmd: __
  170.  DOCUMENTS        1 TO        7                PAGE =     8 OF     13
  171.            AGR & HUMAN RESOURCES, DEPT HORT, HONOLULU, HI, 96822 USA
  172.  SO        THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 1993 FEB, v85, n6-7 p.697-701
  173.  AB        We have applied the recently developed technique of random
  174.            amplification of polymorphic DNA (RAPD) to the analysis of the
  175.            relationships among ten cultivars of papaya (Carica papaya L.).
  176.            Eleven ten-base synthetic oligonucleotides were chosen that gave
  177.            multiple PCR amplification products using papaya DNA as template.
  178.            These 11 primers amplified a total of 102 distinct fragments.
  179.            Cultivars were scored for presence or absence of RAPD fragments and
  180.            grouped by cluster analysis using simple matching coefficients of
  181.            similarity. A dendrogram of the ten cultivars was constructed. Of the
  182.            ten cultivars seven were of the Hawaiian type, and all of these
  183.            grouped to one branch of the tree. Divisions within the Hawaiian,
  184.            branch were mostly consistent with the known genetic background of
  185.            these cultivars. Three non-Hawaiian, cultivars were also analyzed.
  186.            The minimum similarity detected was 0.7 suggesting that the
  187.            domesticated papaya germ plasm is quite narrow. Our results show that
  188.            RAPD technology is a rapid, precise and sensitive technique for
  189.            genomic analysis.
  190.  AK        CARICA PAPAYA L.  POLYMERASE CHAIN REACTION.  GENETIC POLYMORPHISM.
  191.  -------------------------   Press ENTER to see more   -------------------------
  192.  /H:Help       /P:Previous step  /A:Database menu           /S:Search menu
  193.  /U:Scroll up  /F:Print offline  /Q:Quit  /O:Other options  /N:STAIRS  Cmd: __
  194.  DOCUMENTS        1 TO        7                PAGE =     9 OF     13
  195.            PHYLOGENETIC RELATIONSHIP
  196.  KP        QUANTITATIVE TRAITS.  MENDELIAN FACTORS.  PCR.  PRIMERS
  197.  JS        GENETICS & HEREDITY
  198.  RE        16 REFS
  199.  LA        ENGLISH
  200.  DO        ARTICLE
  201.  IS        0040-5752
  202.  TC        For table of contents see UI KP837-0000
  203.  AA        Y
  204.  GA        KP837
  205.  CAUL/ISI08   DOCUMENT=       6 OF       7
  206.   PUBDATE  = 9303           INDATE   = 930812
  207.  RT        I
  208.  UI        KT810-0036
  209.  TI        HIGH LEVELS OF HIV 1 IN PLASMA DURING ALL STAGES OF INFECTION
  210.            DETERMINED BY COMPETITIVE PCR
  211.  AU        PIATAK M.  SAAG M S.  YANG L C.  CLARK S J.  KAPPES J C.  LUK K C.
  212.            HAHN B H.  SHAW G M.  LIFSON J D (Reprint).
  213.  AD        GENELABS TECHNOL INC, DIV HIV & EXPLORATORY RES, REDWOOD CITY, CA,
  214.            94063 USA (Reprint).  GENELABS TECHNOL INC, DIV HIV & EXPLORATORY
  215.  -------------------------   Press ENTER to see more   -------------------------
  216.  /H:Help       /P:Previous step  /A:Database menu           /S:Search menu
  217.  /U:Scroll up  /F:Print offline  /Q:Quit  /O:Other options  /N:STAIRS  Cmd: __
  218.  DOCUMENTS        1 TO        7                PAGE =    10 OF     13
  219.            RES, REDWOOD CITY, CA, 94063 USA.  UNIV ALABAMA, DEPT MED, DIV
  220.            HEMATOL ONCOL, BIRMINGHAM, AL, 35294 USA.  UNIV ALABAMA, DEPT MED,
  221.            DIV INFECT DIS, BIRMINGHAM, AL, 35294 USA
  222.  SO        SCIENCE, 1993 MAR 19, v259, n5102 p.1749-1754
  223.  AB        Quantitative competitive polymerase chain reaction (QC-PCR) methods
  224.            were used to quantify virion-associated human immunodeficiency virus
  225.            type-1 (HIV-1) RNA in plasma from 66 patients with Centers for
  226.            Disease Control stage I to IVC1 infection. HIV-1 RNA, ranging from
  227.            100 to nearly 22,000,000 copies per milliliter of plasma
  228.            (corresponding to 50 to 11,000,000 virions per milliliter), was
  229.            readily quantified in all subjects, was significantly associated with
  230.            disease stage and CD4+ T cell counts, and decreased by as much as
  231.            235-fold with resolution of primary infection or institution of
  232.            antiretroviral therapy. Plasma virus levels determined by QC-PCR
  233.            correlated with, but exceeded by an average of 60,000-fold, virus
  234.            titers measured by endpoint dilution culture. Quantitation of HIV-1
  235.            in plasma by QC-PCR may be useful in assessing the efficacy of
  236.            antiretroviral agents, especially in early stage disease when
  237.            conventional viral markers are often negative.
  238.  KP        HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS.  POLYMERASE CHAIN REACTION.  T CELL
  239.  -------------------------   Press ENTER to see more   -------------------------
  240.  /H:Help       /P:Previous step  /A:Database menu           /S:Search menu
  241.  /U:Scroll up  /F:Print offline  /Q:Quit  /O:Other options  /N:STAIRS  Cmd: __
  242.  DOCUMENTS        1 TO        7                PAGE =    11 OF     13
  243.            RECEPTOR.  HTLV III.  LEUKEMIA VIRUS.  SAN FRANCISCO.  MESSENGER
  244.            RNA.  AIDS.  DISEASE.  QUANTITATION
  245.  JS        MULTIDISCIPLINARY SCIENCES
  246.  RE        71 REFS
  247.  LA        ENGLISH
  248.  DO        ARTICLE
  249.  IS        0036-8075
  250.  TC        For table of contents see UI KT810-0000
  251.  AA        Y
  252.  GA        KT810
  253.  CAUL/ISI08   DOCUMENT=       7 OF       7
  254.   PUBDATE  = 9300           INDATE   = 930812
  255.  RT        I
  256.  UI        KW281-0002
  257.  TI        REVERSE TRANSCRIPTION POLYMERASE CHAIN REACTION - AN OVERVIEW OF THE
  258.            TECHNIQUE AND ITS APPLICATIONS
  259.  AU        OHAN N W (Reprint).  HEIKKILA J J.
  260.  AD        UNIV WATERLOO, DEPT BIOL, WATERLOO N2L 3G1, ONTARIO, CANADA (Reprint)
  261.  SO        BIOTECHNOLOGY ADVANCES, 1993 v11, n1 p.13-29
  262.  AB        The polymerase chain reaction (PCR) has galvanized molecular
  263.  -------------------------   Press ENTER to see more   -------------------------
  264.  /H:Help       /P:Previous step  /A:Database menu           /S:Search menu
  265.  /U:Scroll up  /F:Print offline  /Q:Quit  /O:Other options  /N:STAIRS  Cmd: __
  266.  DOCUMENTS        1 TO        7                PAGE =    12 OF     13
  267.            biologists by virtue of its ability to provide them with large
  268.            quantities of any desired fragment (up to 11kb) of DNA. This power
  269.            combined with its flexibility has also inspired many useful
  270.            applications, including new methods of DNA sequencing, cloning and
  271.            mutagenesis. One logical variation of PCR has been its application to
  272.            the detection and analysis of messenger RNA by the addition of a
  273.            reverse transcription step prior to performing PCR. Due to the
  274.            exquisite sensitivity of PCR, reverse transcription-PCR (RT-PCR) has
  275.            been used to characterize mRNAs previously undetectable by
  276.            established methods of RNA analysis such as Northern hybridization
  277.            and RNase protection assays. Furthermore, its capacity as a method of
  278.            quantitative analysis is currently being developed. RT-PCR has also
  279.            been used to diagnose the presence of certain diseases. Recently,
  280.            RT-PCR has been employed to identify and isolate genes that are
  281.            differentially expressed in different cells or environmental
  282.            conditions.
  283.  AK        REVERSE TRANSCRIPTION.  POLYMERASE CHAIN REACTION (PCR).  RT PCR.
  284.            MESSENGER RNA.  CDNA.  PRIMER DESIGN.  CONTAMINATION.  QUANTITATION
  285.  KP        MESSENGER RNA.  DNA AMPLIFICATION.  RIBONUCLEIC ACID.  GENERAL
  286.            METHOD.  PCR.  INVITRO.  HYBRIDIZATION.  CONTAMINATION.
  287.  -------------------------   Press ENTER to see more   -------------------------
  288.  /H:Help       /P:Previous step  /A:Database menu           /S:Search menu
  289.  /U:Scroll up  /F:Print offline  /Q:Quit  /O:Other options  /N:STAIRS  Cmd: __
  290.  DOCUMENTS        1 TO        7                PAGE =    13 OF     13
  291.            QUANTITATION.  TEMPERATURE
  292.  JS        BIOTECHNOLOGY & APPLIED MICROBIOLOGY
  293.  RE        53 REFS
  294.  LA        ENGLISH
  295.  DO        REVIEW.  NONARTICLE
  296.  IS        0734-9750
  297.  TC        For table of contents see UI KW281-0000
  298.  AA        Y
  299.  GA        KW281
  300.  
  301.  R0601 * END OF D